Бродяга с глазами волка — меткое описание, которым награждают протагониста многие персонажи в игре. Синоби, прозванный Секиро, — верный воин на службе молодого господина Куро, некогда подобранный Филином на поле битвы и прошедший через суровые тренировки. Многочисленные тяготы и особенности воспитания полностью определили его жизненный путь и идеалы: тихий и немногословный, Волк, тем не менее, не остановится ни перед чем, чтобы выполнить то, что ему диктует Железный кодекс: любой ценой защитить господина, а если не удастся, спасти его из плена и очистить свою честь от позора. Именно это ему и предстоит, ведь перед лицом долга даже смерть не способна остановить синоби божественного наследника.
Внешность главного героя была бы достаточно тривиальной, если бы не ряд уникальных черт: одну половину его лица отмечает шрам, полученный от приемного отца, вторая же отмечена серебряной меткой, символом того, что в жилах Волка течет кровь, дающая ему силу перерождения. Волк облачен в старый выцветший плащ, позволяющий ему сливаться с тенями, а ноги его обуты в шуко, особую обувь, позволяющую синоби взбираться почти на любые поверхности. Кроме того, в ходе истории он обзаведется и еще одним уникальным атрибутом — протезом синоби, позволяющим сделать боевой стиль Волка уникальным.
Однако все не могло быть так просто. Пусть у мальчика и был талант, но этот талант следовало оттачивать, постоянно подвергая будущего ниндзя лишениям и заставляя его проходить через битвы. Голод способен сделать из волка отличного синоби... Помогали ему в этом старые мастера: Филин и Леди Бабочка. Они обучали воина искусству владения мечом, премудростям скрытности, ниндзюцу, скорости и техникам боя, день за днем истязая его жестокими тренировками. Все это длилось более десяти лет, но результат того стоил: став к тому времени опытным воином, Волк был приставлен к молодому наследнику рода Хирата — Куро, поклявшись тому в верности.Впрочем, служба не обещала быть легкой, ведь молодого господина, наделенного таинственной силой, всюду преследовал злой рок. Все началось внезапно, в одну из ночей, когда большинство воинов клана отправилось на битву, поместье Хирата было осаждено бандитами, возглавляемыми Дзюдзо. Легко расправившись со стариками и женщинами, остававшимися в крепости, разбойники предали резиденцию владыки огню и перебили большинство мирных жителей, но их злодеяния были отомщены Волком. Отлучавшийся по неизвестному поручению синоби вовремя вернулся в поселение, пробравшись сквозь пожар и перерезав большинство бандитов. Правда, среди огня он обнаружил и нечто прискорбное для себя: его приемный отец, Филин, смертельно раненный, лежал в полыхающих руинах. Передав сыну ключ от тайного храма, в котором должен был спрятаться Куро, старый синоби приказал ученику исполнить то, что требовал Железный кодекс.
Но на этом неожиданности не закончились: божественный наследник действительно оказался в храме, но был он там не один: старый учитель Секиро, Леди Бабочка, окутала ребенка мороком и не хотела отдавать его без боя. Пережив тяжелую битву, Волк сумел освободить своего господина, но получил предательский удар в спину. Филин был жив и имел свои планы на наследника Хирата. Смертельно раненный, протагонист остался лежать в развалинах скрытого Храма.
Но судьба синоби не была предрешена... Вернувшись, Куро отыскал своего верного слугу среди обломков и решил наградить того за верную службу: кровь божественного наследника, переданная молодому синоби, вернула его к жизни и наделила даром, о котором тот долгое время даже не подозревал. Вскоре после разорения поместья, немногие оставшиеся в живых жители покинули насиженные места и направились в земли Асина, покровительствовавших им. Правда, на этом их злоключения не закончились.
